服务器以及C++科学计算安装记录

Author : zbzhen, Modified : Wed Dec 11 20:02:03 2024

1. 服务器以及C++科学计算安装记录

1.1. 硬件

服务器在进门右边的第二层上

显示器接口在服务器后面, 建议用最右边那个

1.2. U盘启动盘

准备一个大于16G的空优盘
下载 ventoy, 并做好启动盘, 这一步非常简单
下载好系统镜像, 建议用镜像, 例如
https://mirrors.aliyun.com/centos/7.9.2009/
https://mirrors.aliyun.com/ubuntu-releases/20.04/
把.iso文件放到ventoy启动盘中

1.3. 安装系统

下面的是centos的安装记录
推荐用ubuntu系统, 不会出现额外报错, 会简单很多

插入ventoyU盘启动盘, 按电源开机
看屏幕信息, 当出现Ctrl + S信息时, 果断按Ctrl+S, 就可以进入Bios界面, 然后按方向键选择USB启动, 最后按F4, 可以进入到安装U盘安装界面, 之后就是跟着提示一步步点, 不会有任何困难. 不用怕装出问题, 无非就是丢失资料.
如果安装出现问题, 不能正常安装, 那么可能需要换U盘, 按电源键关机重启, 再整吧…
进入选择界面后，会有三个选项，第一个是安装，第二个是测试安装，建议先测试一遍，如果出could not insert floppy的错误提醒，可能是linux系统自带的nouvean与NVIDIA卡不兼容导致的. 解决办法为: 选择安装选项，光标停在第一个选项，按Tab进入grub编辑界面，在kernel所在行quiet前加上参数nomodeset，然后按Enter启动安装.
如果不出意外的话，这时候就会进入图形安装界面了，需要注意的是，centos7在安装时，网络配置链接是关闭的，需要手动打开，不然在安装成功后需要手动链接，这会非常麻烦. 具体设置为: 在Installation Information Summary界面（安装信息摘要）点击左下角Network and host进入配置界面，将右上角的off修改成on即可配置成功，注意在此界面右端有本机IP地址. 详细教程可以参考
https://www.jianshu.com/p/78445bc6bd85
忘记root密码.
- 开机时候有提示按方向键和E键的界面, 就按E键进,
- 按方向键, 在linux16所在段的末尾, 设置语言的地方，如LANG=en_US.UTF-8，在后面添加命令
  rw single init=/bin/sh，
- 按下键盘的Ctrl+X执行, 进入单用户界面,
- 输入passwd即可设置新的root密码了,
- 为了让selinux自动初始化，输入：touch /.autorelabel,
- 最后exec /sbin/init 退出单用户模式。
  参考
  https://blog.csdn.net/gnail_oug/article/details/94721777

1.4. 登陆服务器

1.4.1. 快速连接

需要材料:
服务器ip地址, 账号, 密码
例如
地址: 10.10.15.226
账号: zbz
密码: 1234

最快速连接的方法为:

打开终端, 输入
ssh zbz@10.10.15.226
回车, 输入密码再回车, 就能成功连上

1.4.2. 免密登陆

推荐本地用linux系统, 可以很方便处理

本地终端输入ssh-keygen, 一路回车即可
创建记录里, 会出现id_rsa.pub文件的全路径
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub zbz@10.10.15.226
下次直接输入ssh zbz@10.10.15.226可以不用密码

如果是本地是win系统, 则先用某台linux系统整一次免密登陆, 然后执行下面操作

本地终端输入ssh-keygen, 一路回车即可
创建记录里, 会出现id_rsa.pub文件的全路径
把本地的id_rsa.pub中的所有内容, 写入到服务器里的~/.ssh/authorized_keys文件中, 就可以实现免密登陆

win10系统一些操作提示:

终端打开方式: 紧按Shift在桌面空白处点右键–>在此处打开 Powershell 窗口
终端输入cat id_rsa.pub的全路径, 可直接得到id_rsa.pub文件中的全部内容

vim写入文件

vim ~/.ssh/authorized_keys
按i开启编写模式
粘贴id_rsa.pub里的内容
Esc推出编写模式
组合快捷键Shift+z+z保存退出

1.4.3. 软件推荐

win10: MobaXterm(不开源)

跨平台的:

electerm(开源)
windterm 现在完全不推荐
- 它虽然内存占用比较少, 但是它有后面, 而且不是完全开源, 问题很大, 还出现假冒官网投毒事件

vscode + 插件 remote-ssh 或 SFTP 或 SSH Client等. 这种方案真的是方便,但是第一次使用配置起来略微麻烦. 非常推荐

实践表明, 上面提供的三个插件都比较好用, 个人感觉最好用的方案是 vscode + 插件 SFTP, 因为可以本地也会有一个备份, 并且可以选择是否上传, SFTP相关配置文件为

{
    "name": "随意给个名字",
    "host": "ip地址",
    "protocol": "sftp",
    "port": 22,
    "username": "用户名",
    "remotePath": "远程路径", 
    "privateKeyPath": "~/.ssh/id_rsa",
    "uploadOnSave": true,
    "ignore": [
            "**/.vscode/**",
            "**/.git/**",
            "**/.DS_Store",
            "**/__pycache__",
            "**/.env"
        ],
        "watcher": {
            "files": "**/*",
            "autoUpload": false,
            "autoDelete": false
        }
}

1.5. ubuntu命令

查看ip, ifconfig
正常情况下, 安装好了之后就可以远程连接, 如果不行的话, 需要安装SSH, ubuntu命令为
安装sudo apt install ssh
启动service ssh start
重动service ssh restart

1.5.1. ubuntu C++科学计算包

更新软件列表 sudo apt update
更新软件sudo apt upgrade
安装g++, sudo apt install g++
安装gfortran, sudo apt install gfortran
如果报错和sparselib相关, 需要重新下载sparselib++解压后，改文件名，输入make all没报错就OK了
安装umfpack
sudo apt-get install libsuitesparse-dev
sudo apt-get install libsuitesparse-doc
安装gls简单方法sudo apt-get install libgsl-dev, 如果报错: error: ‘size_t’ does not name a type, 则在
/usr/local/include/gsl/gsl_sf_legendre.h文件的#include <gsl/gsl_sf_result.h>下面添加代码#include <cstddef>

1.6. centos命令

1.6.1. cento常用命令

查看ip, ip add
创建账号, adduser zbz
设置密码, passwd zbz
切换账号, su - zbz
切换到root, su - root

1.6.2. cento安装C++科学计算包

安装gcc, sudo yum install gcc
安装g++, sudo yum install gcc-c++
安装gfortran, sudo yum install gcc-gfortran
安装gsl, sudo yum install gsl*
安装umfpack, sudo yum install suitesparse

1.6.3. centos借助syncthing单向同步更新文档

服务器需要做的工作

root用户开启8384和22000端口,
临时开启, 重启后失效
sudo firewall-cmd --add-port=8384/tcp
永久开启, 需要加--permanent参数
sudo firewall-cmd --add-port=8384/tcp --permanent
查看firewall-cmd --list-all
关闭(重启才能生效)
sudo firewall-cmd --remove-port=8384/tcp --permanent
如果防火墙没开启的话可以用过
systemctl start firewalld开启防火墙
systemctl stop firewalld关闭防火墙
官网下载syncthing
https://github.com/syncthing/discosrv/releases/download/v1.8.0/syncthing-linux-amd64-v1.14.0
解压
tar -zxvf syncthing-linux-amd64-v1.8.0.tar.gz
进入文件夹
cd syncthing-linux-amd64-v1.8.0/
启动
./syncthing
关闭Ctrl+C
修改配置文件 vi ~/.config/syncthing/config.xml把127.0.0.1修改为0.0.0.0
温馨提示: vi可以按i进入编写模式, 改写好了之后, 按Esc退出编写模式, 然后组合快捷键Shift+z+z保存并推出
可用cat命令查看有没有修改成功,
cat ~/.config/syncthing/config.xml
后台运行
nohup ./syncthing
可以在本地电脑的浏览器输入10.10.15.226:8384, 然后做适当配置

本地电脑需要做的工作

从syncthing官网下载软件, 并且开启, 做好配置

具体可参考https://kz16.top/sync.html

1.6.4. centos搭建http服务

当然如果想更快速搭建http服务, 那就用python直接一行命令
python -m SimpleHTTPServer 8080
python3 -m http.server 8080

需要开启下8080端口, 然后浏览器中输入 http://10.10.15.226:8080 就可以看到页面内容

后台运行
nohup python3 -m http.server 8080
关闭后台运行
ps -ef | grep python查看pid进程号, 不想继续跑这个后台程序, 就输入kill pid进程号关闭, 例如
kill 8987

1.6.5. centos安装python3

参考 https://www.cnblogs.com/blueberry-mint/p/13106790.html

安装gcc
安装其他依赖包
sudo yum -y install zlib-devel bzip2-devel openssl-devel ncurses-devel sqlite-devel readline-devel tk-devel gdbm-devel db4-devel libpcap-devel xz-devel libffi-devel
下载
wget https://www.python.org/ftp/python/3.8.9/Python-3.8.9.tgz
解压tar -zxvf Python-3.8.9.tgz
创建python3程序目录
mkdir /usr/local/python3

执行配置文件，编译安装python3

cd Python-3.8.9
./configure --prefix=/usr/local/python3
make && make install

一杯咖啡之后…

建立软链接

ln -s /usr/local/python3/bin/python3.8 /usr/bin/python3
ln -s /usr/local/python3/bin/pip3.8 /usr/bin/pip3

测试python3, pip3
如果想再安装一个python3.9, 则前面的安装步骤是一样的, 最后一步, 是覆盖之前的软链接, 也就是
ln –snf /usr/local/python3/bin/python3.9 /usr/bin/python3
删除软链接, 比较保险的一种方式
- cd /usr/bin/python3/
- rm python3.9
- 出现提示
  rm: remove symbolic link ‘python3’?
  输入y即可
- rm python3.9但是python3.9后面一定不能有斜杠/, 如果加斜杠/就把真的目标文件删了
- 如果软链接是文件夹的话就
  rm -rf XXX
  最后一定不要加斜杠/

1.6.6. anaconda的安装

事实上, 用上面的方法虽然能成功安装python3, 但是在安装第三方包总是报错, 为此, 后面直接用anaconda, 具体参考
https://kz16.top/na/python3/

在这里找到对应版本https://www.anaconda.com/distribution/#linux
下载, 例如
wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh
安装bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh
默认会安装在当前目录,
建议安装在/usr/anaconda3
配置环境变量让所有用户生效,
- vim /etc/profile
- 按i进入编辑模式, 在最后一行粘贴
```
PATH=$PATH:/usr/anaconda3/bin/
export PATH
```
- 再按ESc进入编辑模式, 最后组合快捷键Shift+Z+Z保存退出
- 让环境变量生效source /etc/profile

1.7. jupyter配置

1.7.1. 配置

默认情况下，配置文件 ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py 并不存在，需要自行创建。使用下列命令生成配置文
jupyter notebook --generate-config
root 用户
jupyter notebook --generate-config --allow-root

1.7.2. 密码

jupyter notebook password 如果成功会提示 Wrote hashed password to/.jupyter/jupyter_notebook_config.json

1.7.3. 配置文件

在 jupyter_notebook_config.py 中找到下面的行，取消注释并修改。

c.NotebookApp.ip='0.0.0.0'
c.NotebookApp.open_browser = False
c.NotebookApp.port =8888 
c.NotebookApp.notebook_dir = 这里设置下文件夹的位置

1.7.4. 运行

以上设置完以后就可以在服务器上启动 jupyter notebook，jupyter notebook root 用户使用 jupyter notebook --allow-root 注意设置防火墙，例如上面给的是8888端口，就开8888, 这样就可以通过 域名地址:8888 进行访问例如 http://myweb.com:8888/

参考： http://jupyter-notebook.readthedocs.io/en/latest/public_server.html#notebook-server-security_